王冯旦 , 宫婷 , 王琪 , 杨劼 , 杨邹转 , 刘微 , 王博 , 胡国富^*

东北农业大学动物科学技术学院, 哈尔滨, 150000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2020年11月19日    接受日期: 2020年11月27日    发表日期: 2022年08月03日

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为探究羊草种子休眠特性，对赤霉素处理后的羊草种子进行转录组测序，共检测到了 37 208 条Unigene，序列总长为 40 055 874 bp，并使用 MISA 软件对所有的 Unigene 进行 SSR 搜索，共检测到 3 771 个SSR 位点，每 10.6 kb 就会出现一个 SSR 位点。重复基元类型从单核苷酸至六核苷酸类型均有出现，重复基元以三核苷酸为主，占比 56.91%，其次为二核苷酸，占比 24.71%。在 155 种重复基元中，重复基元数量以CCG/CGG 类型最多，占比为 18.38%，其次为 AG/CT，占比 14.35%。SSR 重复次数主要集中在 4~8 次，数量为 3 076 个，占比 81.57%。SSR 长度范围为 12~259 bp，主要集中在 12~24 bp，其中 SSR 长度逸20 bp 的高多态性 SSR 数量为 1 017 个，占比 26.97%。本研究有助于羊草的遗传多样性及分子育种研究。

赤霉素；羊草；转录组；SSR